Chiquimula fue uno de los municipios originales del Estado de Guatemala fundado en 1825; era la cabecera del departamento de Chiquimula, el cual tenía a los municipios de Zacapa, Acasaguastlán, Sansaria, Esquipulas, Jalapa, y Mita.
En 1892, en la demarcación política de la república de Guatemala, oficina de estadística, se menciona a Chiquimula con título de Ciudad.
Actualmente Chiquimula es uno de los municipios más prósperos del oriente de Guatemala.
Por el año 1690 escribió el capitán don Francisco Antonio de Fuentes y Guzmán en su Recordación Florida, sobre el corregimiento de Chiquimula de la Sierra. El arzobispo doctor don Pedro Cortés y Larraz menciona que ocurrieron varios terremotos, especialmente los de la Santísima Trinidad que aconteció en junio de 1765, destruyeron completamente el poblado, reconstruido cercano de las ruinas que hoy en día se admiran, principalmente de su iglesia, que era considerada como una de las más espaciosas y la de mejores líneas arquitectónicas en la arquidiócesis. 1825; era la cabecera del departamento de Chiquimula.