La palabra Zaculeu significa “Tierra Blanca” en idioma Quiché. Los primeros pobladores fueron los Mayas del Altiplano, posteriormente la región fue ocupada por grupos quichés y mames predominando estos últimos a principios del siglo XVI. Según información proporcionada por el portal del Ministerio de Cultura y Deportes, en su sección de “Museos”, el Sitio Arqueológico Zaculeu (Tierra Blanca), anteriormente llamada Xinabajul, fue una de las ciudades más importantes del Señorío Mam del Período Post-Clásico Maya del 500 al 1524 d.C. En 1931, la ciudad fue declarada Monumento Nacional y Monumento Precolombino Nacional en 1970.

En 1976, se obtiene la licencia de excavación para el sitio. Durante dichas excavaciones se recuperaron diversos objetos artesanales, como trozos de vasijas, platos policromados, objetos de oro, plata, cobre y espejos de pirita. También se encontraron restos humanos, el esqueleto de una mujer y una tumba en donde se presume que estaban enterradas 4 persona más.

Ese mismo año se inicia la construcción del Museo, con el objetivo de exponer al público las piezas encontradas durante las excavaciones. Se concluyen las obras en 1980. Debido a que no se contaba con el espacio adecuado para todas las piezas, varias de estas se encuentran en el Museo de Arqueología y Antropología de la ciudad de Guatemala.