Su precipitación media anual es de 1,848mm. con época lluviosa y seca la humedad relativa anual es de 82%, el valor medio de evapotranspiración es de 882 mm. que representa un 48% total de lluvia precipitada. El clima es cálido con invierno benigno húmedo con vegetación natural característica de bosque y estación seca bien definida, la temperatura promedio es de 28 grados y una minima de 18 , los suelos del Parque Ixtutz es mopán (Mp), se trata de suelos aluviales bien drenados, según el grado de drenaje peertenecen a cambiosoles vérticos o gleyisoles y fluviosoles. Los suelos fértiles pero les falta drenaje y adhesividad limitan su uso agrícola. La elevación promedio del área es de 400 a 440 msnm., su topografía es semi ondulada, el área del Parque se ubica en las denominadas planicies aluviales y se trata de grupos de suelos aluviales que se desarrollan en planicies bajas interior de Petén, a lo largo del Río La Pasión, Usumacinta y afluentes en la Cuenca del Río Mopán. Las planicies aluviales están constituidas por terrazas aluviales de diferentes edades. Dentro del área del Parque se ubican los pozos centrales que abastecen de agua al casco urbano de Dolores. El área se ubica dentro de la zona biogeográfica del Neotrópico, se ubica dentro de la zona de vida de bosque muy húmedo subtrópical cálido.En el bosque se ha identificado diferentes especies tanto de valor comercial y no comercial. Entre las que se pueden mencionar: caoba, cedro, amapola, canxán, chicozapote, jobo, malino colorado, manchiche, ceiba, pino de Petén, chacaj. Se han observado armadillos, conejos, mapaches, ardillas, tacuazín, cereque, gato de monte, rata silvestre. En cuanto a las aves: Chachalacas, peas, chejes, tapacaminos, loros cabeza roja, lechuza, gavilán, corales, barba amarilla, mano de piedra, ratoneras, mazacuatas, cutetes, iguanas. Existen 8 hectáreas de reforestación con especies de amapola, cedro, matilisguate, caoba. Existe media hectárea de plantación de xate hembra ambas establecidas en el año 2006.