Las especies representativas del área son: catzé, nogal, madrón, encino, cola de pava, roble, ciprés, pino blanco, canak, chicharro, alisos, palo blanco, moquillo, saquichan, arrayán, quiebra mula, hierba mora, cola de quetzal, gallitos. De las especies de fauna presentes en el bosque son: gorrión, codorniz, pavo de cacho, zopilote, quetzalillo, pájaro carpintero, chipe rosado.Tanto el bosque Santa Rita como San Rafael su polígono presenta forma irregular trazador e forma horizontal en contra a la dirección pendiente del lugar. El clima es frío con relación al resto del país, de tierras húmedas en la mayoría de sus comunidades, la temperatura máxima es de 24 grados y mínima de 15 grados, calculando la temperatura media es de 20 grados todo el año. Los suelos corresponden al grupo altiplanicie central con material madre de ceniza volcánica intemperizada, el relieve es grave inclinado con buen drenaje interno, el suelo superficial es de color café oscuro, con textura franco arenosa fina y espesor de 50 a 75 centímetros, su textura es mixta ya que existen extensiones territoriales arenosas y arcillosas. Actualmente se usa el suelo para cultivar maíz en la parte alta y hortalizas en las comunidades de la parte baja. El bosque de Santa Rita pertenece al período cuaternario de roca ígnea y metamórficas, rellenas y cubiertas gruesas de ceniza pómez de origen diverso. Mientras que el bosque de San Rafael pertenece al período terciario, de tipo roca ígnea y metamórficas, ambos bosques están dentro del paisaje de montaña volcánica altas de occidente y con planicies onduladas. El Cerro Saquibútz es considerado como zona protegida por la zona boscosa que tiene. Entre los ríos que cuenta el Municipio están: El Chichicaste, Bolal, Escondido, Canchegua, El Suj, San Ramón, Tacaná, Guativil,Santo Domingo, Nahuala, Las Provincias, La Parroquia, Agua Tibia, Piedra Blanca, Espumpujá, 3 chorros, riachuelo y ciénega.