La fachada del templo es tradicional, debido a que es de frente alto, tipo espadaña, está entre dos torres que sostienen los campanarios. La estructura tiene columnas con detalles circulares y en su interior, los retablos con un gran valor artístico. La edificación de la Iglesia San José el Viejo quedó completamente en ruinas y en 1990 se iniciaron varios trabajos de restauración para devolverle vistosidad al templo, como fue en sus inicios.
Al igual que otras edificaciones, el uso de esta iglesia luego de que quedara en ruinas no se relacionaba con su propósito original, ya que fue utilizada como una industria de procesamiento de pieles.
Las ruinas de este templo son relativamente pequeñas y están ubicadas sobre la misma calle del Arco de Santa Catalina.
En su jardín se encuentra un árbol de Esquisúchil, llamado del Santo Hermano Pedro de Betancourt.