Está ubicado sobre una extensión de terreno estimada en 3,675 metros cuadrados.

La primera construcción fue sencilla, de adobe y madera, contando con un segundo nivel de madera y es el lugar que ocupa actualmente el anfiteatro, pero ahí funcionaba el pabellón llamado Lazareto que albergó a pacientes mentales y de tuberculosis pulmonar.

Fue en 1838, durante la epidemia del cólera que la Casa de Caridad, atendía a los enfermos de la epidemia y en 1851 se convirtió en hospital.

En marzo de 1940 fue autorizada la construcción del nuevo hospital de Mazatenango el cual fue inaugurado en 1948.

El 14 de febrero de 2014 se llevó a cabo la remodelación de la consulta externa y la ampliación del segundo piso del Hospital Nacional de Mazatenango siendo inaugurada por el ministro de salud Jorge Villavicencio e informó que la obra tuvo un costo de cinco millones trescientos mil quetzales. Las nuevas instalaciones cuentan con 23 clínicas, laboratorios, salas de espera, área para fisioterapia, terapia ocupacional, gineco-obstetricia, medicina interna, pediatría y traumatología y tienen el apoyo de psicólogos, nutricionistas y personal de enfermería.
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