Durante la administración del licenciado Manuel Estrada Cabrera, se construyeron los tramos ferroviarios siguientes: Cocales-Mazatenango; Coatepeque-Las Cruces; Rancho-Guatemala; Palo Gordo-San Antonio y Coatepeque-Ayutla.

En la Administración del licenciado Julio César Méndez Montenegro, se amplió la red ferroviaria con el ramal que conecta al puerto de Santo Tomás de Castilla, durante el gobierno del general Oscar Humberto Mejía Víctores, se construyó el ramal que tiene acceso a los atracaderos del muelle en Puerto Quetzal.

La empresa Ferrocarriles de Guatemala -FEGUA- se constituyó sobre la base de lo estipulado en el Acuerdo Gubernativo dictado en Consejo de Ministros el 27 de diciembre de 1968, el cual declara la caducidad de la concesión otorgada a la empresa de los Ferrocarriles Internacionales de Centro América I.R.C.A.

En la vieja estación ferrocarrilera de Mazatenango, se encuentra una placa de bronce empotrada en una de sus paredes y que conmemora esta disposición.

Para regular su estructura y funcionamiento, se emitió el Decreto número 22-69: «Ley de la Empresa de los Ferrocarriles de Guatemala». Después de varios estudios, se llegó a la conclusión de que era indispensable e impostergable la reestructuración de la empresa, por lo que se tomó la decisión de emitir Decreto número 60-72 del Congreso de la República, con fecha 12 de septiembre de 1972: «Ley Orgánica de la Empresa Ferrocarriles de Guatemala, la que rige actualmente (Walter Estrada Castillo, MAZATENANGO ANTAÑON, 1998).

La vía del ferrocarril fue el medio de transporte más importante de la segunda mitad del siglo XIX. El ferrocarril se inauguró y se puso en funcionamiento en Mazatenango en 1899.