Entre los antecedentes históricos del inmueble, se tiene referencia que a principios de 1900 perteneció al Licenciado José Luis Vargas Palencia (1881-1970) quien fuera trasladado y nombrado como Juez de la Quinta Sala de Justicia en el departamento de Jalapa durante el período de Gobierno de Manuel Estrada Cabrera, habiendo ubicado en el mismo lugar su bufete (cuyo mobiliario se conserva actualmente en dicha sede).

Fue inaugurado como museo el 4 de octubre del 2006, siendo el primero en la Ciudad de Jalapa, recibiendo el nombre de «El Museo de Historia de Jalapa», fundado por el Doctor en Historia Mynor Carrera.

En su interior el inmueble conserva el patrimonio mobiliario y documental de la familia Vargas, adquirida por el fundador del museo.

El inmueble se clasifica dentro de la Categoría «A», según ficha de valorización de categorización de bienes culturales inmuebles, aprobada en la resolución de la Dirección General de Patrimonio Cultural y Natural Número AJ 102-2007 con fecha siete de marzo del 2007.