La construcción de la Catedral y del Convento de Santo Domingo, fue iniciada por fray Francisco de Viana.

La Catedral propiamente dicha fue construida por fray Melchor de los Reyes a mediados del siglo XVI y fue reparada en 1741 y 1792 por el albañil Carlos Pacheco y el carpintero Manuel Sierra, dicha reparación fue dirigida por el ingeniero Oscar Martínez Digueros, la cubierta era de madera con ascendencia mudéjar. Una capilla mayor fue construida por fray Antonio Charle posiblemente a finales del siglo XVII.

En 1885, fray Pedro de Avella la reconstruyó.

Contexto urbano: se encuentra ubicada frente al parque central de Cobán, rodeada por el Palacio de Gobernación (Neo renacentista), El convento de Santo Domingo (colonial) el Palacio Municipal (Art Déco) y un quiosco ubicado en el parque (modernismo de alto contraste en detrimento del contexto), además arquitectura vernácula y contemporánea. Patrimonialmente, debido a sus características históricas, estéticas y constructivas el inmueble se encuentra clasificado con la categoría patrimonial “A” y declarado como Monumento Histórico del Período Hispánico según el Artículo segundo del Acuerdo Ministerial 1210 del Ministerio de Educación del 12 de junio de 1970.