Fuentes y Guzmán, describió en 1690: «La antigua iglesia parroquial de Ostuncalco como excelente fábrica y material y dedicada a la Santísima Natividad de la admirable reina la Virgen de Nuestra Señora y con una Señora Milagrosa que se conoce como Nuestra Señora de Ostuncalco, a raíz de la erupción del Cerro Quemado el 24 de octubre de 1765, dicho templo y gran parte del poblado se vieron seriamente dañados»

En lo referente a sus antecedentes fue dedicada a la Santísima Natividad hacia mediados del siglo XX. Luego fue dedicada a Nuestra Señora de Candelaria, fue elevada a calidad Santuario de Nuestra Señora de Candelaria en el año 2000. Como parroquia es denominada Parroquia de San Juan Bautista.

Patrimonialmente, el inmueble forma parte del Inventario Nacional de Bienes Culturales Inmuebles del Registro de Bienes Culturales desde el año 1995 (Página 33).