Una vez inaugurada, la Ermita de la Santa Cruz funcionó como parroquia. Tras los daños ocasionados por los terremotos de 1717, los habitantes de la región colaboraron en la restauración del edificio. Posteriormente, la ermita pasó a ser filial de la parroquia Nuestra Señora de los Remedios; sin embargo, volvió a sufrir daños con el terremoto de 1773 y nuevamente con el de 1942, que provocó el derrumbe de la cúpula original.

Con el tiempo se realizaron esfuerzos de restauración, y en 1968 se construyeron gradas para adaptar el recinto como un espacio destinado a presentaciones artísticas y culturales. Así, la Ermita de la Santa Cruz quedó habilitada como un teatro al aire libre de carácter permanente.

La fachada de esta ermita es de las pocas en La Antigua Guatemala que, en sus inicios, fue restaurada por los propios pobladores y no por artistas reconocidos. Por su historia y antigüedad, la Ermita de la Santa Cruz es considerada la más antigua del municipio.