Misión
Ser una Universidad cuyos procesos de formación están centrados en el estudiante.
Poseer inspiración cristiana y trabajar con estilo salesiano.
Formar personas comprometidas con el país y con responsabilidad ética.
Orientar su acción hacia los sectores populares y de bajos ingresos de modo prioritario, con el fin de formarlos como profesionales competentes y capaces de insertarse en el mercado laboral.
Impulsar, para el logro de su misión, carreras que contribuyan al desarrollo social y humano del país, con enseñanza de calidad y una investigación pertinente, científica y social.

Visión
La Universidad Mesoamericana será apreciada como un Centro de Educación Superior consolidado, abierto y flexible; vinculado a la solución de los problemas del país, desde su propia identidad y gestionada por un personal éticamente responsable e idóneo técnica, académica y profesionalmente.